El Doctorado en Ciencias Sociales es la primera carrera doctoral interfacultades de la UNNE: lo dictan en conjunto la Facultad de Humanidades y la Facultad de Ciencias Económicas, en el marco del Programa Doctoral de la Secretaría de Políticas Universitarias coordinado por la Secretaría General de Posgrado de la universidad.
La carrera busca formar posgraduados capaces de generar aportes originales tanto a la producción como a la aplicación de conocimientos especializados en ciencias sociales, vinculando los problemas y desafíos de la región con un enfoque interdisciplinario y desde una posición crítica y socialmente comprometida.
El doctorado ofrece dos orientaciones con titulación propia: Estudios Socio-políticos Críticos y Estudios Socio-económicos y Laborales. Cada doctorando elige la suya según su tema de tesis, dentro de una carrera que se autofinancia y cuenta con un director y una coordinadora designados por el Consejo Superior.