La maestría está orientada a profesionales que buscan entrenamiento teórico y experiencia práctica en el desarrollo y la ejecución de estrategias de conservación y manejo de los recursos naturales. Comparte su primer año con la carrera de especialización y le agrega un semestre de cursos propios más el trabajo de tesis. Se dicta en el Pabellón 2 de Ciudad Universitaria.
Al diagnóstico de problemas de conservación de ambientes naturales y de vida silvestre que ya da la especialización, el graduado de la maestría suma la capacidad de diseñar y ejecutar proyectos y estrategias originales, multidisciplinarias y altamente colaborativas para la conservación de la biodiversidad.
Para obtener el título hay que realizar un trabajo individual en forma de tesis aplicando los conocimientos y las herramientas obtenidos en los cursos. El plan de tesis se presenta al Comité de Tesis antes de empezar las asignaturas del segundo año, con el aval de un director de sólida formación en el área, y el trabajo debe tender a resolver un problema concreto de conservación de la biodiversidad; la carrera recomienda que sea multidisciplinario y colaborativo.
Pueden postularse los graduados de la Universidad de Buenos Aires o de otras universidades argentinas con título de grado correspondiente a una carrera de cuatro años de duración como mínimo, y los graduados de universidades extranjeras que hayan completado al menos un plan de estudios de 2.600 horas reloj o una formación equivalente a master de nivel I. También los egresados de estudios de nivel superior no universitario de cuatro años o 2.600 horas reloj, que además deben completar los requisitos que determine la Comisión Académica de la carrera. El Comité de Selección evalúa a los candidatos y puede convocarlos a una entrevista.